Posso criar uma factura a partir de um Orçamento/Proforma pago por Referência MB?

Sim, o processo de criação de Factura é automático.

Assim que o seu cliente efectuar o pagamento do Orçamento ou da Proforma, através das referências de multibanco incluídas no documento enviado, o InvoiceXpress recebe a notificação do pagamento criando automaticamente a Factura, marca-a como Paga e envia-a ao seu cliente por Email, sem necessitar de aceder à aplicação.